0
DNAssist
DNAssist pruža intuitivno jedinstveno sučelje unutar kojeg se prikazuju, uređuju i analiziraju datoteke s nizovima.Korisnik može prilagoditi zaslon u prozorima uređivača odabirom fonta, veličine fonta i duljine retka.Slijed se analizira jednostavnim postavljanjem prozora uređivača na vrh i odabirom potrebne analize iz izbornika.Sve se analize mogu provesti i na odabranom području niza u prozoru za uređivanje.Desnim klikom miša pružit ćete kontekstualni skočni izbornik.Time se korisniku daje zgodna prečac do većine stavki izbornika.Analize dostupne na DNAssist uključuju: Konverzija DNK sekvence između kružnih i linearnih oblika Konverzija DNK u RNA ili proteinsku sekvencu Konverzija RNA u DNK ili proteinsku sekvencu Prevođenje DNK sekvence u sekvencu aminokiselinau jednom, tri ili svih šest okvira Pronalaženje otvorenih okvira čitanja (ORF-ova) u DNK sekvenci Lociranje određenih uzoraka u nizu u nizu (to omogućuje zamjenske znakove, neusklađenosti i praznine) Provođenje restriktivne enzimske analize s definiranim skupom enzima Izvođenje DNA promotoraanaliza s specificiranim faktorima transkripcije Lociranje jakih signala pozicioniranja nukleosoma u DNK Izvođenje višestrukih poravnanja DNA, RNA ili proteina Dobivanje molekulske težine nukleinske kiseline ili proteina Dobivanje temperature topljenja oligonukleotida Izračunavanje pI proteina Izračunavanje hidrofilnog, hidrofobnog iliantigeni profil proteina Dobivanje molarnog koeficijenta apsorpcije i E0.1% nukleinskih aci-jad ili proteina Dobivanje nukleotidnog ili aminokiselinskog sastava nukleinske kiseline ili proteina DNAssist objedinjuje sve te značajke u jednu čvrsto integriranu Windows aplikaciju.Rezultat analize prikazuje se u rezultatskom prozoru i može se ispisati, spremiti na disk ili kopirati i zalijepiti u aplikacije trećih strana.Spremljeni ili kopirani rezultati zadržavaju oblik u kojem su prikazani ....
Web stranica:
https://github.com/mcychan/DNAssist/wikiKategorije
Alternativa DNAssistu za sve platforme s bilo kojom licencom
7
Genome Compiler
Genome Compiler platforma je genetičkog dizajna jednostavna za korištenje, omogućava istraživačima manipuliranje i dizajniranje svega, od pojedinih gena do čitavih genoma.