DiffPDF može usporediti dvije PDF datoteke.Nudi dva načina usporedbe: tekst i izgled.Prema zadanim postavkama usporedba je teksta na svakom paru stranica, ali uspoređuje se izgled stranica (na primjer, ako se promijeni dijagram ili ako se odlomak preformira).Moguća je i usporedba određenih stranica ili raspona stranica.Na primjer, ako postoje dvije verzije PDF datoteke, jedna sa stranicama 1-12, a druga sa stranicama 1-13, jer je dodatna stranica dodana kao stranica 4, one se mogu usporediti određivanjem dva raspona stranica, 1-12 za prvu i 1-3, 5-13 za drugu.To će DiffPDF usporediti stranice u parovima (1, 1), (2, 2), (3, 3), (4, 5), (5, 6), i tako dalje, u (12, 13)....