Cytoscape

Cytoscape

Cytoscape je softverska platforma otvorenog koda za vizualizaciju složenih mreža i njihovo integriranje s bilo kojom vrstom atributnih podataka.
Cytoscape je softverska platforma otvorenog koda za vizualizaciju složenih mreža i njihovo integriranje s bilo kojom vrstom atributnih podataka.Dostupno je mnoštvo dodataka za različite vrste problematičnih domena, uključujući bioinformatiku, analizu društvenih mreža i semantički web.Cytoscape podržava mnoge slučajeve upotrebe u molekularnoj i sistemskoj biologiji, genomici i proteomici: učitajte skupove podataka o molekularnoj i genetskoj interakciji u mnogim formatima Projektirajte i integrirajte globalne skupove podataka i funkcionalne napomene Uspostavite snažne vizualne preslikave preko tih podataka. Izvršite naprednu analizu i modeliranje pomoću Cytoscape dodataka. Vizualizirajtei analizirati skupove podataka putova po mjeri čovjeka poput Reactome ili KEGG.
cytoscape

Značajke

Alternativa Cytoscapeu za sve platforme s bilo kojom licencom

Polinode

Polinode

Polinode je alat koji olakšava izvođenje snažne mrežne analize.Možete prenijeti vlastite mrežne podatke ili upotrijebiti integrirani alat za ispitivanje na temelju odnosa za prikupljanje podataka za vas prije analize i vizualizacije vaših mreža.
KeyLines Graph Visualization Toolkit

KeyLines Graph Visualization Toolkit

KeyLines je JavaScript alat za brzu izgradnju aplikacija visokih performansi grafikona.
Pathomx

Pathomx

Pathomx je alat koji se temelji na radnom toku za analizu i vizualizaciju eksperimentalnih podataka.
Prefuse

Prefuse

skup alata za vizualizaciju prefuse
Tabnetviz

Tabnetviz

mrežni vizualizator temeljen na tablici, alat naredbenog retka za proizvodnju statičkih mrežnih vizualizacija iz tablice čvorova i rubne tablice.