Cytoscape je softverska platforma otvorenog koda za vizualizaciju složenih mreža i njihovo integriranje s bilo kojom vrstom atributnih podataka.Dostupno je mnoštvo dodataka za različite vrste problematičnih domena, uključujući bioinformatiku, analizu društvenih mreža i semantički web.Cytoscape podržava mnoge slučajeve upotrebe u molekularnoj i sistemskoj biologiji, genomici i proteomici: učitajte skupove podataka o molekularnoj i genetskoj interakciji u mnogim formatima Projektirajte i integrirajte globalne skupove podataka i funkcionalne napomene Uspostavite snažne vizualne preslikave preko tih podataka. Izvršite naprednu analizu i modeliranje pomoću Cytoscape dodataka. Vizualizirajtei analizirati skupove podataka putova po mjeri čovjeka poput Reactome ili KEGG.